而这时，柯南也将连环杀人案推理到了最后的真相阶段。
在东京塔里，被“安排”成为最后凶手的人，和真正的凶手对峙了。他们都是为了一个死在一场火灾里的女孩而痛苦着，一个想要赎罪，一个想要复仇。
一直关注着案件进度的琴酒，已经从仓库里将直升飞机开了出来。
而时刻关注爱尔兰进度的贝尔摩德，也积攒了足够的杀心：她知道爱尔兰发现了柯南的身份，甚至一直在爱尔兰身边，美其名曰“保护易容”，实际上紧跟警方进度。
爱尔兰则在破案的过程中逐渐被工藤新一的聪慧折服。
他原本只想将工藤新一当做琴酒的把柄，但在他抢到记忆卡，却被开着直升飞机的琴酒毫不留情 “灭口”后，他反而在濒危时硬是护住了工藤新一。
他没有将工藤新一的身份说开，而是保护了工藤新一，并且告诉工藤新一：你是破坏掉组织的希望。他甚至明白了自己为什么会落到这个地步，于是他说：“难怪贝尔摩德会这么看重你……”
但是，如果我落入这样的境地，是因为贝尔摩德和琴酒合作的话，那么，一直被认为对组织无比忠诚毫无私心的琴酒，原来……原来……
真是太好笑了。他忍不住想笑，却瞳孔涣散，最后失去了意识。
琴酒的直升飞机没能成功飞走，中途被一颗足球攻击。琴酒千钧一发时机自己握住了飞机的操纵杆，成功让飞机降落了。他想起了突然出现的那颗足球……那个被那么多人护着的小孩，倒确实有点别的本事。
他想起了上次伏特加错误理解了板仓卓的信息。那时候他当然发现了柯南，但在那之前不管是柯南还是贝尔摩德都表现出想要保护这个小孩的模样，所以他放了人一马。
或许那时候他已经无意中做出选择。
最后飞机坠毁，琴酒本人和带着的人都没什么事。琴酒看着面前的残骸，给后勤组拍了照。他没什么心理负担：反正用过了他就开心了。战损本来也不是他负责。
夜晚，从警方那里得知，没有查到假扮松本清长的人的身份长相的柯南，忍不住想起了说出那番话的爱尔兰。
他忍了忍，最后旁敲侧击问了问父亲：赤井先生最近的状态如何。
他已经意识到，赤井那里知道的组织情报一定比雪莉多。
“那家伙当初可是行动组的风云人物。”灰原哀在得知柯南和赤井合作以后曾说过这番话，“他和玛格丽特表面敌对实际兄妹同心，而玛格丽特是琴酒的下属，那这不就说明他那几年对组织的行动几乎了然于心吗”
“不过，能不能让他开口说出情报，就看你的了。”雪莉说，“至少姐姐的事，他没有告诉fbi。”
这也是雪莉信任赤井的理由之一。
当然，这几天，在知道了“赤井秀一被琴酒杀死”后，雪莉一直是“假的吧又是假死”这种态度。
柯南试图掩饰，但无法改变雪莉的刻板印象。
“他不是很擅长假死吗而且……”雪莉的目光透露出一点复杂的神色，“如果玛格丽特当初是假死，那么……那么她的假死一定有琴酒的手笔，至少有琴酒的漠视。那么，对理论上他更喜欢的莱伊，他说不定会做得更多。”
柯南也是后来才知道，开枪“杀死”赤井的是琴酒本人。
他追问赤井，却没有得到答案，此时却听到雪莉这么说。
“但是赤井先生说，他和琴酒是不死不休的关系。”他说。
雪莉翻了个白眼：“这种说法……”
看着面前的纯情高中生/小学生，雪莉不由得忍下了“不死不休难道不是至死纠缠的意思”这句话。
她说：“如果你认为那家伙立场坚定，那这不是很好吗琴酒会为他改变。”
“但是琴酒那种人……”
“好了，江户川。”雪莉打断了柯南的话，“你不适合探究这种复杂的关系。”
柯南确实想不通，但这不妨碍他认为赤井的立场坚定，并且是个很好的人。他在询问过工藤优作后，打通了赤井的电话。
“赤井先生，那个放着组织卧底名单的id卡还是被销毁了，但是爱尔兰……”他将经历过的一切描述给赤井听。
“爱尔兰是皮斯科的养子。”赤井说，“他很讨厌琴酒。”
“皮斯科！是那个……”